Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms