Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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