Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms