Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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