Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms