Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP1-4P0C5Y4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms