Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BP0C0L5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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