Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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