Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGB3P05106 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms