Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SEC24DO94855 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SEC24DO94855 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SEC24DO94855 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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