Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms