Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms