Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COBLO75128 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COBLO75128 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COBLO75128 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COBLO75128 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COBLO75128 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COBLO75128 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COBLO75128 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COBLO75128 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COBLO75128 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COBLO75128 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms