Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SLC25A20O43772 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms