Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLX3O43711 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms