Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXNDC9O14530 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms