Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms