Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms