Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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