Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHMP3Q9Y3E7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms