Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms