Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms