Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPA4Q9UI42 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms