Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms