Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APEX2Q9UBZ4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms