Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS7AQ9UBW8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms