Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX3Q9UBR4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms