Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms