Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms