Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDP1Q9P0J1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms