Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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