Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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