Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms