Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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