Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HMG20AQ9NP66 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HMG20AQ9NP66 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HMG20AQ9NP66 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HMG20AQ9NP66 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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