Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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