Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms