Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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