Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms