Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC13A1Q9BZW2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms