Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms