Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms