Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms