Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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