Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms