Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms