Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNRIP1Q96F85 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms