Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms