Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUB2Q96DC9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms