Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms